?水環境eDNA無人值守系統的應用

水環境eDNA無人值守系統的應用

目前，環境DNA（eDNA）采樣及分析已經成為一種變革性技術，但樣本采集方法缺乏標準化，而且要以有效的頻率進行采樣需要大量的現場工作。于是，能夠支持現場以一定頻率的、自主工作采樣的eDNA采樣系統提供了解決這些問題的可行方案。我們展示了四個案例研究的結果，這些研究使用了美國地質調查局快速環境eDNA評估和部署倡議及網絡（READI-Net）項目的一個原型自主eDNA采樣器。這些案例研究涉及在各種河流棲息地短期部署一個eDNA自動采樣器（美國史密斯公司—上海蔚雨科技有限公司代理），(a)探究高頻全自動采樣設備的采樣質量，及(b)這些自動樣本與手動收集的樣本進行基準對比。高頻自動采樣揭示了eDNA濃度的時間相關性，并提供了關于eDNA與環境協變量（如排放和濁度）關聯的寶貴洞見。

評估表明，自動采樣設備的檢測率與人工采樣樣本相似，并獲得了一致乃至更高的eDNA濃度及檢出率。同時，自動采樣系統中得到了最小的攜帶污染。可以預見，eDNA自動采樣器在減少人力成本的同時，能夠使eDNA采集流程標準化，并探究環境變量對eDNA結果的影響。

技術參數：

型號：eDNA ASC

原產地：美國

品牌：史密斯

通道數：8個

環境溫度：＞0℃

取水高度：0~2米

防水等級：IP43

流速范圍：0.1~1.4L每分鐘

GPS功能：GNSS

水泵接口：按壓式 0.375英寸管徑

泵吸力：10~12PSI

規格：78.74×53.34×39.37cm

重量：45kg

續航方式：交流電源供電/電池續航：30天

案例1：美國地質調查局哈德遜河流域部署

全自動采樣系統被安裝在美國地質調查局（USGS）位于紐約州奧爾巴尼以北大約13公里的哈德遜河上的一個測流站（圖1）。該測流站位于河流公里數248附近，距離特洛伊大壩（及相關船閘和水電站）上游約0.2公里，這是大西洋上游的第一個內陸流域。在這個位置，河流的海拔高度大約為5米，寬度為280米，排水面積為20,953平方公里，年平均流量為每秒411.7立方米。取水口位于測流站房屋垂直下方大約5米，水平方向17米處，這要求自動采樣器跨越這個高度差和距離進行吸水。除了為自動采樣器提供保護外，測流站還在部署期間記錄了瞬時（15分鐘間隔）河流水位、流速和濁度數據。流量是使用指數速度法計算的，濁度監測使用了YSI EXO2聲納和濁度傳感器。

案例2：愛達荷州櫻桃溪

在位于蒙大拿州博茲曼東南35公里，櫻桃溪岸邊安裝了自動采樣系統，距離其與麥迪遜河匯合處上游約25公里。櫻桃溪的海拔范圍從源頭約2652米，到研究地點約1717米，再到與麥迪遜河匯合處約1350米。自動采樣器所在位置的排水面積和坡度分別為79平方公里和1.5%。在研究期間，溪流寬度約為3米，流量約為0.20立方米/秒。這段溪流是一個大型本地魚類恢復項目的一部分。

案例3：伊利諾伊州Loggers Creek

     設備安裝在愛達荷州博伊西的Loggers溪岸邊，距離其與博伊西河匯合處上游約2.4公里。Loggers溪是一條長5公里、淺、坡度低的溪流，位于博伊西河洪泛平原，蜿蜒穿過博伊西市中心東側的住宅區，海拔830米。在研究期間，溪流寬度約為3米，流量約為0.67立方米/秒。

自動采樣系統完成了兩次離散收集，從2023年7月26日至28日和8月1日至3日，每天采集八次樣本（每三小時一次），共計31個樣本。我們在8月3日收集了最后一個現場樣本后，用自動采樣器采集了一個現場空白樣本。

案例4：Big Piney River, St. Robert, 密蘇里州

自動采樣系統被放置在位于密蘇里州圣羅伯特以東6.5公里處的Big Piney河岸邊。Big Piney河位于奧扎克高地地區，是密蘇里河流域的一部分，從密蘇里州卡布爾附近的上游源頭向東北方向流動177公里，最終與加斯科內德河匯合。自動采樣器位于河流公里標記13附近，該處河流的大致海拔為230米，寬度為40米，流域面積為1878平方公里。最近的美國地質調查局（USGS）測量站，位于自動采樣器位置上游大約19公里處，平均年流量為20.5立方米/秒。

相關樣本調查研究數據可瀏覽網絡資料文獻：Field Trials of an Autonomous eDNA Sampler in Lotic Waters